Нам очень нужны волонтеры молекулярные биологи и биоинформатики для помощи в наполнении и курировании портала. Напишите нам

Привет всем, у меня есть файл родства, рассчитанный программой KING, который содержит 5 столбцов: ID1, ID2, HetHet, IBS0, Kinshi(родство). У меня также есть fam-файл, но мне не хватает данных об отце и матери для каждого человека. Есть ли способ восстановить родословные данные из текущих данных, которые у меня есть?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

Если вам нужно восстановить родословные, пробовали ли вы что-то вроде PRIMUS?
Вы можете ввести генетические данные, а также оценки IBD:
https://primus.gs.washington.edu/primusweb/
Или вы можете выяснить отношения (если вам нужно просто идентифицировать родителей), глядя на значение родства (> 0,5 близнеца / дубликата,> 0,2 PO или полная родственность).

ответил от (3.1k баллов)