Если сгенерировать на компьютере случайным образом последовательность ДНК, то чем она будет отличаться от реальных отсеквенированных последовательностей?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

Дело в том, что аденозин/гуанозин, тимидин и цитидин (мы ведь говорим про нуклеотиды, а не про азотистые основания) – это химические соединения, свойства которых различаются и определяются их структурой и ДНК в организме выполняет там определённые функции. Эти функции часто привязаны к определенным элементам, которые имеют характерную структуру, соответственно отличаться такая ДНК от случайной будет "всем".
Если подойти к вопросу формально и сделать вид, что про функции ДНК нам ничего неизвестно, то и в этом случае отличий будет немало, а именно:
1. GC состав.
2. Частота k-меров.
3. Повторы.
4. Частотными характеристики
Кстати, часто изпользуют сгенерированные случайные последовательности, чтобы проверять и доказывать различные гипотезы в процессе работы.

ответил от (3.1k баллов)