Я пытаюсь загрузить как можно больше сборок вирусных геномов. Мне удалось обнаружить, что EMBL-EBI имеет большое их количество, но я не могу найти их на их FTP. Какие еще существуют источники вирусных сборок и как загрузить сборки EMBL-EBI?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

Много вирусных сборок можно найти на этом ресурсе:
https://www.viprbrc.org/brc/home.spg?decorator=vipr
Попробуйте эту ссылку на FTP EMBL-EBI:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Viruses/

ответил от (3.1k баллов)
Здравствуйте,
Здесь у вас есть некоторая неточность.
Этот ресурс ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Viruses/
относится к NCBI (National Center for Biotechnology Information), т.е. США,
и не имеет отношение к EMBL-EBI (The European Bioinformatics Institute).
Что касается сборок геномов , то для поиска лучше пользовать другие  сервисы с поиcком:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/
или
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/