Я пытаюсь провести предсказания генов в сборке генома de novo.
Как мне это сделать? Какие есть инструменты, статьи на эту тему?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

Это очень общий вопрос. Вы можете научиться делать предсказание генов, читая различные статьи с конкретными кейсами о предсказании генов или читая статьи о пайплайнах. К таким пайплайнам относятся PGAAP, RAST, BASys, Clovr и CG-Pipeline. Имеет смысл также начать с этой отличной обзорной статьи:
https://www.nature.com/articles/nrg3174

ответил от (3.1k баллов)