Я работаю с бактериальными геномами и хочу провести пан-геномный анализ. Какие инструменты лучше использовать для этого?
BPGA - это один из лучших инструментов для этой работы. Он подходит для работы и на Linux и на Widnows. Еще можно посмотреть на этом ресурсе там собраны все инструменты для пан-геномного анализа: https://omictools.com/pangenomics-category