У меня есть нуклеотидная и белковая последовательность исследуемого гена, есть ли инструменты для построения структуры гена наряду с интроном, экзоном и доменами?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

Лучший ответ

Для моделирования структуры/конформации белка из последовательности белка, взгляните на различные алгоритмы, перечисленные на портале модели белка:
https://www.proteinmodelportal.org/?pid=modelling_interactive
Есть также целый ряд других инструментов, перечисленных которые перечислены здесь:
https://www.expasy.org/proteomics/protein_structure
Для вашей нуклеотидной последовательности используйте GENSCAN для прогнозирования интронов и экзонов:
http://hollywood.mit.edu/GENSCAN.html
Вы также можете BLAST последовательности, чтобы увидеть, какие части отображаются на интроны и экзоны.

ответил от (3.1k баллов)
выбран от