Нам очень нужны волонтеры молекулярные биологи и биоинформатики для помощи в наполнении и курировании портала. Напишите нам

Какие сервисы есть для реконструкции метаболического пути для набора генов или белков, представляющих интерес ? В частности, я пытаюсь определить общие функции или пути в наборе генов. Я знаю, что могу посмотреть на функции в Gene Ontology и использовать David. А какие есть еще методы для этого?

спросил от (5.4k баллов)

1 Ответ

ConsensusPathDB - это система которая включает в себе почти все базы данных с публичным доступом.

http://cpdb.molgen.mpg.de/

Есть еще ingenuity IPA, но она платная, зато кроме публичных данных содержит миллион курированных вручную ассоциаций между генами и метаболическими путями, которые извлекли из научных публикаций.

http://www.ingenuity.com/products/pathways_analysis.html

ответил от (3.1k баллов)