Нам очень нужны волонтеры молекулярные биологи и биоинформатики для помощи в наполнении и курировании портала. Напишите нам

Нам известны такие пакеты, как SVA и ComBat, которые можно использовать для корректировки данных для batch-эффектов или биологических артефактов. Однако в большинстве случаев все корректирующие переменные рассматриваются как факторы. Поэтому я хочу знать, может ли кто-нибудь предложить мне какой-либо пакет, в котором я мог бы приспособиться к «непрерывным» переменным / случайным величинам. У меня есть несколько из них для корректировки. Кто-нибудь может предложить мне простой в использовании метод?

спросил от (5.4k баллов)
редактировать от

1 Ответ

В R вы можете просто включить значения непрерывной переменной в параметры вашей матрицы. Можно также подогнать линейную модель через вашу ответную переменную как функцию от ковариат, которые вы хотите исправить. Затем извлеките остатки из модели и используйте их в качестве новой переменной.

ответил от (3.1k баллов)
редактировать от